承担厦门市行政区域内属于省级考核事权的生态环境质量监测工作；按要求做好重点污染源监督性监测、环境应急监测和预测预报等工作的技术支持；承担九龙江流域内跨设区市河流断面水环境监测质量控制、信息汇总、综合分析等技术工作；负责省内近岸海域的生态环境监测；根据国家、省的要求开展驻地市空气质量预报，负责完成信息发布。